Desde el punto de vista bacteriológico, cuando no se utiliza como fuente de abastecimiento de agua a la explotación la de los núcleos humanos sometida a estricta vigilancia, es necesario realizar un análisis bacteriológico del agua de abrevamiento al menos una vez al año.

En el medio rural, el problema de los pozos presenta un aspecto distinto, la calidad del agua depende de la profundidad y emplazamiento de los pozos, de la naturaleza del suelo y de las filtraciones potenciales vecinas; por lo tanto conviene vigilar cuidadosamente la utilización de esta agua, ya que puede carecer de olor y de sabor a pesar de estar infectada.

Especial atención merece la presencia de bacterias coliformes que se consideran como gérmenes acompañantes de microorganismos patógenos e indicadores de una contaminación fecal o por aguas residuales, la acción del ozono es este caso es clara y determinante, los elimina rápidamente.